L’assemblage du génome se réfère au processus de prise de nombreux petits morceaux de la séquence génétique et les fusionner en un tout cohérent qui représente la totalité du génome d'un organisme. C'est un axe majeur de la bioinformatique domaine, et une variété de projets de génomique n'existe à cet effet. Ensemble de génome a été utilisé pour commencer l'analyse des génomes de nombreuses espèces, y compris les humains, les animaux, les plantes et les bactéries.
L'analyse des gènes d'un organisme est un processus long, et l'ensemble du génome est l'une des premières étapes. Beaucoup d'autres méthodes d'analyse sont construites sur l'assemblage de succès, et l'identification de gènes ne peuvent pas progresser sans elle. Même avant gènes se trouvent un ensemble de génome succès peut encore générer beaucoup d'informations utiles pour une analyse ultérieure, y compris la taille du génome, sa structure, sa composition générale.
Le processus d'assemblage du génome, c'est comme mettre un puzzle ensemble sans avoir une image ou des formes utiles comme un guide. Lorsqu'il est confronté à des premières pièces du génome, appelé lectures brutes, il y a rarement des indications où une pièce particulière va, ou même comment il est orienté. Chaque morceau est codé de façon similaire avec les quatre bases de l'ADN, en abrégé A, C, G et T. Le génome peut être compactée en un grand chromosome ou divisée en plusieurs. Il n'est aucunement garanti que certaines des premières lectures ne sont pas des doublons de la même région du génome, ce qui signifierait que moins d'information unique existe qu'il n'y paraît à première vue.
La connaissance générale de la structure du génome est inestimable lors du démarrage du processus d'assemblage. Bien que les génomes entre espèces sont très différentes, il y a certaines règles que les types de génome spécifiques suivent, et elles peuvent être appliquées lors de la mise un autre génome de ce même type ensemble. Par exemple, si un certain type d'organisme a toujours un motif particulier à proximité où les gènes sont trouvés, on peut raisonnablement supposer, lors de l'assemblage d'un autre organisme semblable, que la recherche d'un tel modèle serait le signe d'un gène voisin. À plus grande échelle, de nombreux génomes bactériens ont un chromosome circulaire, de sorte qu'il serait raisonnable de s'attendre à ce que toutes les lectures brutes d'une nouvelle bactérie serait en quelque sorte s'emboîter sur un chromosome. L'application de la connaissance génétique générale de cette manière peut permettre à un chercheur de commencer à faire sens de potentiellement des centaines de milliers de morceaux de données.
Il existe de nombreuses autres méthodes qui peuvent être utilisées dans l'assemblage du génome, y compris des prédictions informatiques et des comparaisons manuelles. Quel que soit le procédé, l'assemblage du génome est un travail important qui est souvent fastidieuse et difficile. Comme il est la base de nombreuses analyses génétiques futures sur un organisme, il ya peu de place pour l'erreur.
L'analyse des gènes d'un organisme est un processus long, et l'ensemble du génome est l'une des premières étapes. Beaucoup d'autres méthodes d'analyse sont construites sur l'assemblage de succès, et l'identification de gènes ne peuvent pas progresser sans elle. Même avant gènes se trouvent un ensemble de génome succès peut encore générer beaucoup d'informations utiles pour une analyse ultérieure, y compris la taille du génome, sa structure, sa composition générale.
Le processus d'assemblage du génome, c'est comme mettre un puzzle ensemble sans avoir une image ou des formes utiles comme un guide. Lorsqu'il est confronté à des premières pièces du génome, appelé lectures brutes, il y a rarement des indications où une pièce particulière va, ou même comment il est orienté. Chaque morceau est codé de façon similaire avec les quatre bases de l'ADN, en abrégé A, C, G et T. Le génome peut être compactée en un grand chromosome ou divisée en plusieurs. Il n'est aucunement garanti que certaines des premières lectures ne sont pas des doublons de la même région du génome, ce qui signifierait que moins d'information unique existe qu'il n'y paraît à première vue.
La connaissance générale de la structure du génome est inestimable lors du démarrage du processus d'assemblage. Bien que les génomes entre espèces sont très différentes, il y a certaines règles que les types de génome spécifiques suivent, et elles peuvent être appliquées lors de la mise un autre génome de ce même type ensemble. Par exemple, si un certain type d'organisme a toujours un motif particulier à proximité où les gènes sont trouvés, on peut raisonnablement supposer, lors de l'assemblage d'un autre organisme semblable, que la recherche d'un tel modèle serait le signe d'un gène voisin. À plus grande échelle, de nombreux génomes bactériens ont un chromosome circulaire, de sorte qu'il serait raisonnable de s'attendre à ce que toutes les lectures brutes d'une nouvelle bactérie serait en quelque sorte s'emboîter sur un chromosome. L'application de la connaissance génétique générale de cette manière peut permettre à un chercheur de commencer à faire sens de potentiellement des centaines de milliers de morceaux de données.
Il existe de nombreuses autres méthodes qui peuvent être utilisées dans l'assemblage du génome, y compris des prédictions informatiques et des comparaisons manuelles. Quel que soit le procédé, l'assemblage du génome est un travail important qui est souvent fastidieuse et difficile. Comme il est la base de nombreuses analyses génétiques futures sur un organisme, il ya peu de place pour l'erreur.
