Un score LOD est une représentation de la probabilité d'un lien entre les deux traits génétiques. Si le score est élevé, cela signifie que les traits sont étroitement liées, et donc généralement héréditaire ensemble. Les scores faibles, d'autre part, indiquent une faible liaison. La compréhension de ces numéros est important de généticiens pour un certain nombre de raisons, allant de vouloir comprendre des conditions génétiques particulières à un désir de comprendre où un gène est situé, en utilisant les informations sur les gènes connus.
Pour comprendre l'importance du score LOD, il est utile de savoir que les loci deux sont proches les uns des autres, plus il est probable qu'ils seront transmis ensemble. Si les gènes sont sur différents chromosomes , par exemple, ils sont généralement hérités séparément, parce que beaucoup de croisement peut se produire au cours de la méiose .Les gènes qui sont sur le même chromosome, mais éloignés sont aussi généralement hérités indépendamment. Quand loci sont à proximité sur le même chromosome, cependant, ils ont tendance à être hérités ensemble. Cette information est à la racine du système de notation.
LOD est synonyme de «logarithme de la cote», reflétant le fait que le nombre est exprimé logarithmique. En règle générale, si le score est de 3 ou plus, cela signifie qu'il y a une forte probabilité de liaison génétique. Les nombres faibles indiquent une probabilité moindre de liaison génétique, mais ils peuvent encore être utiles dans le processus d'élimination.
Pour déterminer un score LOD, un échantillon de données est nécessaire, et dans ce type d'analyse statistique, plus l'échantillon, mieux c'est. Les chercheurs qui travaillent avec des organismes tels que les mouches des fruits peuvent se reproduire activement la population à faire ressortir ou de supprimer les caractéristiques souhaitées dans le but d'étudier le lien entre les traits spécifiques, tandis que les populations comme les humains, les chercheurs doivent eux-mêmes les données recueillies par l'observation confiner. Grands échantillons ont tendance à donner des informations plus statistiquement significatif, car ils réduisent le risque de douves et les grappes qui fausser les données.
En utilisant les données d'une population d'intérêt, les chercheurs examinent comment souvent certains traits se produisent ensemble, et combien de fois ils apparaissent séparément. Cette information est utilisée pour arriver à la fréquence de recombinaison, en regardant comment souvent des traits génétiques se recombinent. Pour être sur le même chromosome, la fréquence de recombinaison doit être inférieure à 50%, et il faut diminuer encore plus pour indiquer que les loci sont proches les uns des autres. Les chercheurs analysent ces informations pour déterminer quelle est la probabilité qu'il y ait un lien génétique ou non. Le score LOD est déterminée en divisant la probabilité de liaison par la probabilité d'aucun lien. En règle générale, les scores sont calculés pour plusieurs loci.
