Le innée du système immunitaire est la première ligne de défense contre l'infection par des microorganismes tels que les virus, les bactéries et les parasites du corps. Cette branche du système immunitaire est considéré comme inné, car il est immédiatement activée lors de l'infection de se défendre contre tous les agents pathogènes. En revanche, le système immunitaire acquis, deuxième ligne de défense de l'organisme, est une réaction beaucoup plus précis qui prend du temps à construire. Le système immunitaire inné est constitué d'une attaque sur plusieurs fronts qui comprend des barrières physiques à l'infection, les cellules immunitaires et de molécules de protéines appelées cytokines et complément.
Parmi les obstacles physiques à l'infection, le plus important est la peau. Quand intacte, la peau est imperméable à la plupart des agents pathogènes envahisseurs, et d'autres mécanismes tels que la transpiration aide à éliminer les bactéries et les virus de la peau. De même les larmes, le mucus, la salive et les agents pathogènes ras des yeux et du nasopharynx. Le tube digestif est également une partie du système immunitaire innée. Les mécanismes de défense à cet emplacement comprennent l'acidité des voies, des enzymes qui digèrent la matière organique et des protéines antibactériennes appelées défensines.
Quand un agent infectieux est capable de contourner ou de nier ces barrières physiques, la première réaction du système immunitaire inné est une réponse inflammatoire. Cette réponse est stimulée par la libération de substances chimiques inflammatoires par les cellules qui sont blessés ou mourants. L'inflammation peut être déclenchée non seulement par une infection, mais aussi par une blessure. Lorsque l'infection est présente, toutefois, les mécanismes de défense supplémentaires sont déclenchés en même temps que l'inflammation. Ceux-ci comprennent à la fois les réponses cellulaires et chimiques.
La présence d'agents pathogènes dans un site d'inflammation déclenche la libération d'un grand nombre de produits chimiques différents, dont certains tout simplement favorisent l'inflammation et dont certains ont d'autres rôles. En réponse à la présence de protéines bactériennes, une cascade chimique appelé le système du complément est déclenchée. Il s'agit d'une chaîne de réactions chimiques impliquant un grand nombre de protéines différentes. L'achèvement de la cascade du complément aide à tuer les bactéries envahissantes, et recrute également des cellules immunitaires au site de l'infection.
D'autres substances, telles que la lactoferrine , la transferrine et le lysozyme, sont également produites sur le site de l'infection. La lactoferrine et la transferrine lier le fer disponible pour limiter sa disponibilité pour les bactéries, tout en lysozyme permet de détruire les bactéries en décomposant leurs parois cellulaires. Immunitaires des produits chimiques spécifiques au système appelées cytokines sont produites aussi bien. Ceux-ci comprennent les interférons, qui aident à réduire le taux de réplication virale, et l'interleukine-1, ce qui augmente l'efficacité de la réaction de complément.
Bien que ces réactions chimiques se développent, les cellules du système immunitaire inné, y compris les neutrophiles, les macrophages et les cellules tueuses naturelles, ont aussi leurs propres parties à jouer. Ces cellules sont recrutés au site de l'infection par des cytokines et d'autres protéines inflammation promotion. Tous les trois types de cellules combattent les agents pathogènes envahisseurs, mais le faire via des mécanismes différents. Neutrophiles et les macrophages tuent en engloutissant les cellules bactériennes et les digérer, alors que les cellules tuent naturelles détruisent les cellules qui ont été infectées par des virus. Les macrophages sont également impliqués dans le déclenchement de l'immunité acquise, qui se développe en réponse à l'infection continue.